出社から始業時刻までのあいだに仕事を始めた場合は、仕事を始めた時刻が始業時刻となるため、定時に出社したものと扱うことはできません。

労働時間に当たるかどうかの判断は、使用者の指揮命令下にあるかどうかで行います。
そして使用者の指揮命令下にあるかどうかは、就業規則の定めにかかわらず、実態で判断されます。

始業時刻前に出社し、始業時刻までのあいだ新聞を読んだり、コーヒーを飲むなど自由に過ごしている場合は、定時を始業時刻として問題ありません。
実務上の問題として、PCのログなどとタイムカード（勤怠管理システム）の記録に乖離がある場合、行政の調査などで指摘を受けるリスクがあります。

行政から指摘を受けないためにも、始業時刻より大幅に早い出社を制限したり、実出社時刻と定時の乖離が生じた理由を記録するなどの対応が重要です。