就業規則を電子申請する場合の大まかな流れは以下のとおりです。
なお、電子署名や電子証明書の準備は不要です。

1　パソコンなどの事前設定
下記の3つを準備・設定します。
➀e-Gov（イーガブ）アカウントの準備：e-Gov電子申請を利用するときのアカウント発行
➁ブラウザの設定：自身が使用するブラウザが適応しているかの確認
③アプリケーションのインストール：e-Gov電子申請に必要となるアプリケーションをインストール（※OSによって異なります）

参考｜e-Gov「e-Gov電子申請」

2　e-Govアプリ、マイぺージへのログイン
e-Gov電子申請のアプリをインストール後、アプリを起動させ、マイぺージにログインし、手続検索から申請を進めてください。

根拠法令・参考情報
厚生労働省『「36協定届」や「就業規則（変更）届」など労働基準法などの電子申請がさらに便利になりました！』